En 1997 se entregaron los primeros certificados con una vigencia anual, pero dados los costos de todo tipo que representan para las empresas el poder obtenerlos, la Profepa determinó ampliar su validez de uno a dos años, al término de los cuales pueden ser refrendados por un lapso igual, previa solicitud de la empresa y de una revisión por parte de Profepa para constatar que la empresa mantiene o ha mejorado su nivel de cumplimiento de la normatividad ambiental. Los Certificados de Industria Limpia representan una forma de reconocimiento y estímulo que la Semarnat, a través de la Procuraduría Federal de Protección al Ambiente, otorga a las industrias que cumplen oportunamente los compromisos adquiridos en las auditorias ambientales. La Procuraduría instrumentó el otorgamiento de tales certificados en 1997; los primeros fueron entregados en abril de ese año, lo que no quiere decir que antes de esa fecha no existieran empresas que pudieran haber sido acreedoras de tal reconocimiento.